В соответствии с основными задачами и возложенными функциями практическая деятельность осуществляется во взаимодействии:
с ФЭУ ФСИН России - по вопросам, касающимся финансовой деятельности, бухгалтерского учета и отчетности, нормативного регулирования денежного довольствия и оплаты труда, пенсионного обеспечения и социальной защиты личного состава академии;
с соответствующими подразделениями Администрации Рязанской области, Управления федерального казначейства по Рязанской области, Управлением федеральной налоговой службы России по Рязанской области, отделениями государственных внебюджетных фондов РФ по Рязанской области - по входящим в его компетенцию вопросам;
с отделом кадров академии - по вопросам подготовки и повышения квалификации сотрудников финансово-экономического отдела, подбораи расстановки кадров;
с отделом тылового обеспечения академии - по вопросам материально-технического обеспечения, учета, сохранности, рационального использования и списания материальных ценностей и денежных средств, относящимся к компетенции финансово-экономического отдела;
с секретариатом и юридической службой академии - по вопросам претензионной, исковой и договорной работы, подготовки и совершенствования локальных актов;
с другими отделами и службами академии - по вопросам финансово-хозяйственной и экономической деятельности академии и Псковского филиала Академии ФСИН России;иными органами и учреждениями в интересах решения задач, возложенных на финансово-экономический отдел.